El museo ofrece a los visitantes un lugar donde encontrarse con la historia e identidad de pueblos americanos, así como con el arte virreinal y jardines.

Fue concebido como un museo de antigüedades en 1873 y se recolectó material de diversos países americanos dando inicio a una colección importante donde podemos encontrar: objetos de cultura pre-hispánicas, imaginería, pintura colonial, platería litúrgica, textiles arqueológicos, etnográficos e históricos, etc. El museo es una clara muestra del sincretismo y el mestizaje que se dio en los países de América Latina tras la llegada de los españoles.

'''Algunos datos interesantes:'''

* Los colores de la fachada citan el escudo mercedario

* En el interior de la basílica se encuentra la segunda imagen católica más antigua del país, la Virgen de la Merced, traída a Chile el año 1548